5月28日，未及清军攻至，明军焚毁淮河大桥后南逃，清军随后在第三日，未遇任何抵抗后，平安渡过淮河。

6月7日，清军兵临扬州城下。

6月8日，高杰部将总兵杨承祖率军降清。同一日，高杰部将李本深也率部投降。

6月10日，不属四镇的总兵张天禄与张天福两兄弟也率部下三千人降清。

6月12日，高杰部将总兵李成栋率部向清军投降。

清军在扬州外围几乎未遇任何抵抗，反而因招降大批明军部队，使得自身实力大增。南京弘光朝廷苦心经营一年多，用尽江南财赋建成的江北四镇，临战时，却都望风而逃，争相投敌，江淮防线立时土崩瓦解。

清军合围扬州，并未立即攻城，盖因扬州乃大城，清军统帅多铎担心仅靠步兵云梯，很难攻下，便屯大兵于城下，等待红衣大炮到来。

而此时，长江江面上，近百艘战船聚集于镇江至瓜洲渡一带长江沿岸，无数逃难的士绅百姓，蜂拥地要往停靠在岸边的船上涌来，性急的，直接跳入江中，奋力地游向大船，但靠近船只的难民，均被船上的兵士挥舞着矛杆和刀鞘，又一一打落于江中，哭喊声，吼叫声，怒骂声，不绝于耳。

还有部分逃难民众在惊恐之下，就抱了一个木盆，便跃入江中，试图泅渡长江，逃到南岸。但是到了江心，往往一个江浪涌来，人便没入水中，片刻消失不再。自瓜洲渡以下，江面之上不断有浮尸漂于其中。