既然北京已经不是国都了，辽东和漠南被收复，九边防线也已外扩，边境处于和平阶段，大运河的作用变得有限，直达辽东的海运崛起是必然的了。

既省钱，又快捷，还避免了每年沿途的几千万石粮食损耗。

在地方上，朱慈烺统一地方行政，省下面统一设府、州、县、乡、保、村、里。

自唐宋元以来，乡一直是乡村组织中最大的单位，明朝的乡村组织和元代一样，但南北两地有很大不同。

北方的乡村分为三级，最大的叫乡，其次是社，最小的是村。

元朝时社是由五十户组成，明朝不固定，一般都超过五十户的限制，村的人数则是比设还少。

南方，乡村的组织分为四级，乡、保、村、里。

南方的保，是宋朝的都保制而来，村则是普遍的村落，里并非里甲制的里，而是原有自然乡村的名称，是南方那些小规模的村落。

南方的乡村中，还有“区”和“图”，总而言之，明朝的乡村组织，北方保留了金、元以后乡里制及社制的色彩，而南方则深受宋代都保制的影响，很复杂。

朱慈烺直接将之统一规划，各省巡抚到任后，第一件事就是落实地方基层行政单位，并且彻底完成分田地，加强治安管理。

新的行政下，知县是依旧是正七品，乡长是正八品待遇，保长是正九品待遇，村长从九品......