叶卡捷琳娜宫办公室设36个内设机构：

(一)综合调研处。负责组织起草太子殿下在重要会议上的讲话稿等。组织起草或审核向上级部门或魔王的综合性汇报材料以及重大事项的专题报告。根据全国社会情况和政府工作重点，协调组织开展应用性的调研，形成调研报告，供太子殿下参考。

(二)秘书处。负责太子殿下相关会议会务、记录和纪要撰写。负责太子殿下牵头召开的重要会议会务工作。负责叶卡捷琳娜宫办公室工作调研的总协调。负责由太子殿下负责活动的服务保障。负责落实政府领导工作协作制度。

(三)外交一处。负责办理各外交方面的文件、会务和调研工作。

(四)国防一处。负责办理各部队相关的文件、会务和调研工作。

(五)国防二处。负责办理各军事院校方面的文件、会务和调研工作。

(六)国防三处。负责办理各军事工厂、研究所等方面的文件、会务和调研工作。

(七)国防四处。负责办理各军民共建方面的文件、会务和调研工作。